37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3239 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 96 aa  189  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  63.83 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  46.07 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  42.55 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  43.01 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  41.76 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  43.33 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  41.38 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  41.11 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  37.63 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  39.36 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  42.05 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.42 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  37.23 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  35.11 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  35.63 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  28.72 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  34.52 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.63 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  29.76 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  33.01 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.95 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.41 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.41 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.41 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  34.41 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  30 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  32.61 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4792  plasmid stabilization system  34.41 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583044  normal  0.319008 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  28.89 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.31 
 
 		 106 aa  40  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>