26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4208 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  57.89 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  56.84 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  42.05 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  43.01 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  41.05 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  35.05 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  35.79 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  32.56 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.03 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.71 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.04 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  25.61 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  31.91 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.48 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  23.66 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  27.47 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  24 
 
 		 103 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>