68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1846 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  100 
 
 
99 aa  199  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  47.96 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  47.96 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  33.73 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  41.25 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.43 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  39.76 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  31.58 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4525  plasmid stabilization system protein  32.99 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  32.26 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.63 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 
99 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  29.35 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  34.12 
 
 
98 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  28.26 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.64 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3207  plasmid stabilization system  30.93 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0463225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 
103 aa  52  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  27.55 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  32 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  34.07 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5396  plasmid stabilization system  30.53 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  0.0135014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  30.21 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  30.21 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.02 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  28.26 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  37.68 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  30.85 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  31.25 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  27.96 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  26.53 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  30.95 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  31.52 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2829  plasmid stabilization system protein  26.73 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2757  plasmid stabilization system protein  26.47 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2059  plasmid stabilization system protein  26.47 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0175569  normal  0.0247897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1314  plasmid stabilization system protein  26.73 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  30.93 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  31.76 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3886  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.498769  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  30.77 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  36.84 
 
 
93 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  23.66 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  29.35 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  29.76 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  29.41 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  26.58 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  22.34 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.89 
 
 
103 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  27.91 
 
 
101 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  29.55 
 
 
94 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 
91 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  29.89 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  30.34 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  30.34 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.78 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  29.21 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  25 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  28.26 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03820  Plasmid stabilisation system protein  30.34 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  21.43 
 
 
109 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>