65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0849 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  204  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  96 
 
 
100 aa  193  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  86.87 
 
 
101 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  84 
 
 
100 aa  176  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  83 
 
 
100 aa  174  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  78.57 
 
 
100 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  90.8 
 
 
87 aa  158  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  66.33 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  61.22 
 
 
103 aa  123  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  59.41 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  55.1 
 
 
102 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  45.56 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  39.36 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.08 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  41.46 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  40.96 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  30.39 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  32 
 
 
110 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  35.96 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.98 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  34.09 
 
 
96 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  30.3 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  27 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  27 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 
94 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  31.25 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  31.52 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  33.33 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  30.77 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  32.98 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  27.66 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.23 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  27.66 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  27.18 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  37.08 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  30.77 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  26.14 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  37.18 
 
 
103 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  36.36 
 
 
93 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  31.33 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  30.53 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  34 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2622  hypothetical protein  30.21 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.428303  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.35 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 
100 aa  40  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  25.29 
 
 
96 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  25.29 
 
 
96 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  25.49 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 
99 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  22.92 
 
 
102 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  33.71 
 
 
94 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  28.71 
 
 
108 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  25.49 
 
 
112 aa  40  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>