34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1790 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.25 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  38.1 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  36.54 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  34.29 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  33.98 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  34.31 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  31.48 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  33.65 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  34.62 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  30.1 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  33.65 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.87 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  30.1 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  30.1 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  30.39 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  28.71 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  31.18 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  26.04 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  27.72 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  27.18 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  27 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  25.26 
 
 		 99 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0681  hypothetical protein  29.41 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  28.72 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  33.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0746  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  27.18 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000854899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  29.47 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  25.24 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  25.24 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  32.35 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  28 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>