60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4641 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  86.87 
 
 		 100 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  84.85 
 
 		 100 aa  174  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  81.82 
 
 		 100 aa  170  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  80.81 
 
 		 100 aa  167  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  76.53 
 
 		 100 aa  156  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  83.72 
 
 		 87 aa  147  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  67.35 
 
 		 103 aa  139  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  62.38 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  62.63 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  53.06 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.9 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.14 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  44.44 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  40.96 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  40.96 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  34.31 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  38.04 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  35.96 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  32.32 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  33 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  31 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  36.36 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  29 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  32.32 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  31.96 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.52 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  31.68 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  30.39 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  31.46 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  26.92 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  27.47 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  26.92 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  33.73 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  24.49 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  28.87 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  31.52 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  28.87 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  32.29 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.23 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  30 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.1 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  35.23 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  33.71 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  32 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  27.66 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2622  hypothetical protein  29.03 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.428303  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  28.09 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  28.09 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  29.67 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>