95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7898 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 		 97 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  71.84 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  60.64 
 
 		 96 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  57.29 
 
 		 100 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  63.22 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  48.35 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  43.96 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  50 
 
 		 94 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  47.25 
 
 		 93 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.91 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  41.49 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.25 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  41.49 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  46.94 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  49.32 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.05 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.05 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  45.05 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.05 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  41.76 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  45.88 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  43.18 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  45.45 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  44.94 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.78 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.22 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  43.01 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  43.3 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  40.66 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  41.76 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  43.68 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.46 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  39.56 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  36.56 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  44.09 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  43.82 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  44.09 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  42.22 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  40.86 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  41.05 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  44 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  37.63 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  41.86 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  37.36 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  37.36 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.91 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  36.26 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  40.86 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.41 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  41.79 
 
 		 348 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  39.78 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  39.78 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  30.59 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3627  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0782046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.26 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 92 aa  48.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.74 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  34.83 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  37.36 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  31.87 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  42.03 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  34.48 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  35.23 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  35.23 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.18 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  32.18 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  32.18 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.9 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.12 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  34.09 
 
 		 100 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  29.07 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1411  hypothetical protein  33.75 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0345542  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  29.07 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  35.23 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4905  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  38.89 
 
 		 120 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>