75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3170 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  42.7 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  43.16 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  41.49 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  36.78 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  39.56 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  39.78 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  35.56 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.22 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  40.91 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  41.76 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  37.78 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  38.89 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  34.78 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  33.71 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  37.5 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  36.17 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  38.04 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  38.89 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  35.23 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  34.07 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  36.96 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  36.96 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  35.16 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  37.84 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 94 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  39.56 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.87 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.44 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  33.72 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.7 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  33.33 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  30.77 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.82 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  36.49 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  35.16 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 94 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  34.83 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  37.93 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  31.25 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  38.1 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.63 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  46.55 
 
 		 348 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  30.21 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  30.68 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.37 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3627  plasmid stabilization system protein  32.88 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0782046  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  30.34 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.11 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  31.52 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1400  hypothetical protein  34.38 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  31.08 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>