22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1400 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1400  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  140  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  63.08 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  60 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  47.46 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  46.88 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  46.55 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  44.83 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  31.25 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.25 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.81 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.54 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  37.29 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  35.82 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  40.32 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  39.68 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  40.68 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>