76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2785 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  100 
 
 
91 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  60.44 
 
 
95 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  58.24 
 
 
96 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.11 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  54.55 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  52.75 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  42.22 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  46.15 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  48.89 
 
 
101 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  47.78 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  49.45 
 
 
94 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  40 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  54.05 
 
 
79 aa  80.1  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  43.33 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  50 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  50 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  52.17 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  38.89 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  44.57 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  42.22 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  44.94 
 
 
93 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  37.78 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  33.33 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.56 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  35.56 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  37.36 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  37.63 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  37.36 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  35.16 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  36.26 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  35.16 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  35.16 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  33.71 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  37.84 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  38.04 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  38.64 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  36.47 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  32.22 
 
 
94 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.23 
 
 
100 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  28.57 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  29.67 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.82 
 
 
348 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  30.43 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  36.26 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1400  hypothetical protein  35.82 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666984  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.37 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.73 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  41.27 
 
 
90 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  29.21 
 
 
89 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  31.87 
 
 
99 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  31.18 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>