105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1854 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 		 94 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  95.74 
 
 		 94 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  65.93 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  58.06 
 
 		 94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  69.41 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  58.06 
 
 		 94 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  48.35 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  46.67 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  44.44 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.91 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  36.56 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.05 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  41.3 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  43.18 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  38.71 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  41.05 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  40.66 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  42.86 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.11 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  45.45 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  42.22 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.3 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  33.33 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  41.38 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  38.67 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  40.22 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  38.04 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  36.26 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0834  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.96 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  33.33 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  38.71 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.79 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  48.39 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  32.22 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  37.08 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  41.33 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  40.91 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  40.91 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  40.86 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  31.4 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  36.67 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  37.93 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  38.64 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  24.72 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  34.09 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  35.11 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3885  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.44 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0194678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  38.2 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  30.61 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1400  hypothetical protein  31.25 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  28.16 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  35.87 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  30.93 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  32.99 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  26.14 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  32.99 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  32.97 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  33.71 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>