99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3762 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  100 
 
 		 93 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  52.22 
 
 		 94 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  50 
 
 		 93 aa  100  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  54.35 
 
 		 93 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  50 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  50 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.35 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.35 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.35 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  48.35 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  51.11 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.35 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.69 
 
 		 95 aa  92.8  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.35 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  47.78 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  46.74 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  47.78 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  50.56 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.91 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  45.65 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  49.44 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  45.16 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  41.94 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.24 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  45.45 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  46.67 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  41.76 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  54.44 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  54.44 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  39.56 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  41.3 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  40 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  46.51 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  41.3 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  38.46 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  37.78 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  51.11 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  40.62 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  48 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  41.57 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  34.04 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  41.57 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  43.3 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  40.23 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  36.67 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  37.23 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.74 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.26 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  31.4 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  34.78 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  28.26 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  34.78 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.28 
 
 		 348 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  37.5 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  35.96 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  36.26 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.67 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  41.27 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  50.98 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  28.26 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1987  plasmid stabilization system  36.17 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0276791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.66 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  37.08 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  35.96 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.35 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1157  plasmid stabilization system protein  40.91 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  34.83 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  37.21 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  36.67 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0044  hypothetical protein  44.9 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.203145  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  31.46 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  35.23 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.41 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.53 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3627  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0782046  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.7 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1400  hypothetical protein  39.68 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  35.05 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>