51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4341 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
99 aa  204  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  78.35 
 
 
98 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  48.35 
 
 
91 aa  83.6  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  43.16 
 
 
94 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  41.3 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1400  hypothetical protein  60 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666984  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  43.48 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  41.3 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  41.57 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.23 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.78 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  33.7 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  31.03 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  34.78 
 
 
94 aa  53.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.34 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  30.34 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  31.91 
 
 
93 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.46 
 
 
94 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  34.48 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  38.71 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  35.87 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  31.52 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  29.55 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.38 
 
 
94 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  39.56 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  32.61 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  35.48 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  35.48 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  32.88 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  32.61 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  36.26 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  30.43 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  28.42 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.18 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  31.52 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  34.78 
 
 
104 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  31.18 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  29.67 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  28.74 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  29.03 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  31.18 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.46 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  27.84 
 
 
100 aa  40  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  29.9 
 
 
100 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>