42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1248 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.14 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  42.55 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  37.89 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  38.95 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  37.89 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  39.56 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  39.36 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  43.01 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  37.78 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  36.96 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  38.64 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  45.9 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  39.02 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  36.73 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  34.65 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  38.2 
 
 		 103 aa  50.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  31.87 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  34 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  36.96 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  34.41 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  40 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  28.42 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  26.14 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  26.88 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>