24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5620 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  100 
 
 		 106 aa  216  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  60.78 
 
 		 103 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  57.84 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  52.43 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  47.22 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  49.02 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  48.54 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  49.51 
 
 		 99 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  47.06 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  47.17 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  44.12 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  44.94 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  63.46 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  43.33 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  36.63 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  43.27 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  36.63 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  34.65 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  35.64 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  47.69 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.62 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.65 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  34.02 
 
 		 93 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>