36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3002 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  36.67 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  43.96 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  36.9 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  36.96 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  36.96 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  40 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  36.17 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  36.96 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  36.14 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  37.08 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  32.63 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 100 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  34.78 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  38.1 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  32.58 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.56 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  34.02 
 
 		 106 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  26.09 
 
 		 98 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>