32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1226 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
99 aa  201  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  84.85 
 
 
99 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  83.84 
 
 
99 aa  170  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  63.37 
 
 
102 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  57.28 
 
 
103 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  62.24 
 
 
99 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  58.42 
 
 
102 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  49.51 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  61.73 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  54.12 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  47.57 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  44.23 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  50.68 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  38.83 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.01 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  42.39 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  34.04 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  38.71 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  42.11 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.66 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  42.39 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  29.67 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
92 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
96 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  36.59 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  31.52 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  39.33 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  30.43 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  32.93 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>