40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1217 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
96 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  88.42 
 
 
96 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  87.78 
 
 
92 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  89.53 
 
 
86 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  75.79 
 
 
96 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  74.39 
 
 
83 aa  120  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  41.05 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  41.05 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  42.11 
 
 
100 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  35.87 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  42.11 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.11 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  36.84 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  35.48 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  40 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  33.7 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  38.54 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  30.53 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  30.53 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  30.53 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  30.53 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  36.56 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  31.52 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  31.52 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  29.47 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5346  plasmid stabilization system  29.35 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.461356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  31.33 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  36.17 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  25 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>