42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6361 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
96 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  57.73 
 
 
97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  56.7 
 
 
97 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  55.67 
 
 
97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  47.92 
 
 
96 aa  103  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  53.06 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  66.1 
 
 
61 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  46.94 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  44.79 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  51.14 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  47.96 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  43.88 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  44.09 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  41.67 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  42.11 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0424  hypothetical protein  50.68 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  40 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  43.48 
 
 
99 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  41.49 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  35.16 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  40 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 
99 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  42.17 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  38.38 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  37.62 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  34.78 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  41.98 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  40.66 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0416  hypothetical protein  31.52 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  37 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_004310  BR0407  hypothetical protein  31.52 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  26.88 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  33.7 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  31.87 
 
 
89 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  29.67 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>