23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0132 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  57.84 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  54.81 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  46.67 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  43.27 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  43.27 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  41.35 
 
 		 99 aa  66.6  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  44.23 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  40.95 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  45.71 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  38.46 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  45.95 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  37 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  34 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  37 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  35.05 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  33.66 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  36.36 
 
 		 87 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  33.66 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  50 
 
 		 96 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  32.67 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  35.05 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>