34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3927 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 99 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  98.78 
 
 		 82 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  61.22 
 
 		 99 aa  130  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  61.22 
 
 		 99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  55.88 
 
 		 102 aa  116  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  62.24 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  52.94 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  55.77 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  52.43 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  51.72 
 
 		 87 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  48.31 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  45.19 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  32.63 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  36.19 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  42.57 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  32.63 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  42.39 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  41.05 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  34.02 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.74 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  36.67 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  42.37 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  29.67 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>