21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1556 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  45.45 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  46.07 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  45.95 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  50 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  50 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  44.94 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  55.56 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  55.56 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  41.57 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  57.14 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  38.2 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  50.88 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  45.95 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  41.1 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  41.67 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  39.19 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  34.33 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  32.1 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  46.34 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>