28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0823 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  62.5 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  55.88 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  59.41 
 
 		 99 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  57.43 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  63.37 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  52.43 
 
 		 106 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  55.29 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  52.94 
 
 		 99 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  51.92 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  60.32 
 
 		 82 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  46.07 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  41.35 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  42.42 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  42.42 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  41.41 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  43.16 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  36.73 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  36.73 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  39.39 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  43.55 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  35.42 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  36.11 
 
 		 101 aa  43.9  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  32.63 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0151  hypothetical protein  29.17 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000158576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>