36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0925 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 96 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.92 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  46.88 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  45.36 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  44.33 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  44.33 
 
 		 97 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  45.92 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  46.88 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  52.46 
 
 		 61 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  43.88 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  40.82 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  44.57 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  43.88 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  42.39 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  40 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  37.23 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  35.16 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  37.11 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  36.73 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  39.58 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  37 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  41.1 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0424  hypothetical protein  41.33 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  35.29 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  33.67 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  27.78 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  39.51 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  40.38 
 
 		 91 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>