24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0144 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  100 
 
 		 83 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  80 
 
 		 92 aa  140  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  75.61 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  74.39 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  73.49 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  69.88 
 
 		 86 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  41.98 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  41.98 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  36.14 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  40.74 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.98 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  35.8 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.57 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  34.15 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  37.04 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  29.27 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  29.27 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  29.27 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  29.27 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  33.75 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>