29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1961 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  191  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.88 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  40.82 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  39.8 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  38.78 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  37.76 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  44.33 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  42.11 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  40.82 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  38.95 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  37 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  40.66 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  41.18 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  39.58 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  35.05 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  36.56 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  38.71 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  43.33 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  36.56 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  33.67 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  39 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  35.42 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  34.02 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  34.15 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  36.73 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>