34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2500 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  73.2 
 
 		 97 aa  148  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  48.98 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  47.96 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  47.96 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  45.92 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.94 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  45.45 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  46.94 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  51.02 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  44.33 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  37.89 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  44.79 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  48.1 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  38.27 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  41.67 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  48.21 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  43.16 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  37.8 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0424  hypothetical protein  46.67 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  39.24 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  34.04 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  47.69 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  42.39 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  42.39 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  44.87 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  45.45 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  39.8 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  35.63 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  39.19 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  43.75 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  35.8 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  35.05 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>