33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1668 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  62.5 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  60.78 
 
 		 106 aa  126  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  55.77 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  55.34 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  54.81 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  54.37 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  57.28 
 
 		 99 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  50.96 
 
 		 99 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  47.57 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  45.19 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  54.55 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  60.32 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  45.45 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  38.14 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  38.14 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  37.11 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  37.11 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.05 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  38.2 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.38 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  41.49 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  32.63 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  35.05 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  30.21 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  32.99 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  46.43 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  32.56 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  31.4 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3446  plasmid stabilization system  32.63 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0746  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  27.66 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000854899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>