20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4497 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  47.22 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  45.19 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  43.27 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  41.35 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  35.19 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  40.2 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  39.81 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  34.82 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  37.37 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  50.88 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  50.94 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  49.06 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  35.64 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  35.64 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  33.66 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  33.67 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  39 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  52.63 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>