30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3593 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 82 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  98.78 
 
 		 99 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  62.96 
 
 		 99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  60.49 
 
 		 99 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  54.12 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  52.94 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  61.73 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  56.32 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  51.76 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  54.05 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5620  plasmid stabilization system  53.33 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  44.59 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  38.27 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  39.51 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  45.45 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  32.05 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4497  plasmid stabilization system  49.06 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  43.53 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  35.44 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  34.62 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  34.62 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  34.62 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  43.21 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  36.25 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  38.71 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.62 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  40.68 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>