46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0141 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  100 
 
 		 96 aa  196  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  88.42 
 
 		 96 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  87.91 
 
 		 92 aa  166  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  87.06 
 
 		 86 aa  158  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  78.95 
 
 		 96 aa  153  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  75.61 
 
 		 83 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  42.55 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  42.55 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  41.49 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.02 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  38.95 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  37.23 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  39.56 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.49 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  36.56 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  38.27 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  38.3 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  40 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  38.3 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4276  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  29.03 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  30.85 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  30.21 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5346  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  29.21 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  30 
 
 		 156 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  27.37 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.56 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 94 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  34.38 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  30.85 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>