49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2576 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2576  plasmid stabilization system  100 
 
 		 96 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  46.88 
 
 		 96 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  47.92 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2500  hypothetical protein  51.02 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.67 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  46.94 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  40.21 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  39.18 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1344  plasmid stabilization system  42.11 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  39.18 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0503  plasmid stabilization system  45.92 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1389  plasmid stabilization system protein  41.3 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  39.36 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  40 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  38.3 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0823  plasmid stabilization system protein  38.95 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1226  plasmid stabilization system protein  42.39 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3927  plasmid stabilization system protein  41.05 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2428  plasmid stabilization system protein  44.26 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1668  hypothetical protein  36.08 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275714  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1961  hypothetical protein  33.67 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  38.75 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3593  plasmid stabilization system protein  43.21 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02069  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02062  plasmid stabilization system  40 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0132  hypothetical protein  36.08 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191476  hitchhiker  0.0000356046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0424  hypothetical protein  41.33 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5922  plasmid stabilization system  35.42 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.389759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  33.72 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  26.14 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0144  plasmid stabilization system  37.04 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.394444  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  33.7 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  30.59 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2487  plasmid stabilization system protein  26.37 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000234328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  31.46 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  28.09 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1556  plasmid stabilization system protein  32.88 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601678  normal  0.980277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>