33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_C0021 on replicon NC_009787
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  95.6 
 
 		 91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  68.13 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  68.13 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  68.13 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  68.13 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  62.64 
 
 		 91 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  59.34 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  61.54 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5346  plasmid stabilization system  62.64 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  53.85 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0480  plasmid stabilization system protein  41.76 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  30.77 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  34.07 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  32.18 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  26.19 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  31.82 
 
 		 94 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.95 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.19 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  26.74 
 
 		 99 aa  41.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  26.44 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>