98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2453 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  100 
 
 		 94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  93.62 
 
 		 94 aa  184  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  56.99 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  50 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  52.75 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  44.68 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  46.24 
 
 		 94 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  48.89 
 
 		 93 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  45.05 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  42.11 
 
 		 79 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.3 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  40.96 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.22 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  45.26 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  36.17 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  39.13 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  42.22 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.22 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  41.3 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  38.46 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  38.71 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.11 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.56 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  37.08 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  37.08 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  44.19 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  40.22 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  34.41 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  40.66 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  36.99 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  36.67 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.75 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  35.16 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  32.97 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  36.96 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  35.16 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  39.73 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  35.63 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  32.97 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  32.56 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  35.87 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.67 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  52.08 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  35.48 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  30.77 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  37.68 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  35.48 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  35.48 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  34.41 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.32 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 94 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  35.82 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  31.68 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  36.36 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  36.36 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  30.53 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0606  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  29.76 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  34.44 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.58 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  31.31 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 97 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  29.07 
 
 		 89 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 		 103 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  27.78 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.68 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  33.71 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3567  plasmid stabilization system protein  27.85 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1149  plasmid stabilization system  29.17 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2581  plasmid stabilization system  29.17 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  27.85 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  34.67 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  28.24 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  27.85 
 
 		 111 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>