21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1466 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  73.12 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  47.78 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0606  plasmid stabilization system  44.09 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  42.22 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  38.46 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  32.58 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  38.46 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  37.5 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  34.83 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.48 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  31.18 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  29.27 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  37.5 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  30.23 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  29.21 
 
 		 94 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>