23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4130 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 101 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  73.12 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  43.33 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0606  plasmid stabilization system  42.42 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  37.63 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  40.66 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.89 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  33.71 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  32.99 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  30.68 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  26.97 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  30.56 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  29.47 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  35.82 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.65 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  23.96 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  32.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>