98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0943 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  100 
 
 		 94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  93.62 
 
 		 94 aa  184  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  55.91 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  50 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  54.95 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  45.74 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  46.24 
 
 		 94 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  47.78 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  45.05 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.3 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  43.24 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.22 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  37.23 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  40.96 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  43.16 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  39.13 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.04 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  41.3 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  37.36 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  41.11 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  37.63 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.57 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  36.56 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  37.08 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  42.05 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.04 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  40.91 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  44.3 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  48.33 
 
 		 348 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  35.96 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  36.99 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  37.78 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  36.96 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  35.16 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  34.07 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  36.26 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  38.46 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.89 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  34.07 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  35.16 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  32.97 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  37.84 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  49.15 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  38.36 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  31.03 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  36.56 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  37.31 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  35.56 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  35.79 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  35.48 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0606  plasmid stabilization system  32.58 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  37.68 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.67 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  35.48 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  35.48 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1466  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.151492  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  33.66 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2653  hypothetical protein  30.95 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  32.86 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  34.34 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  35.35 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3567  plasmid stabilization system protein  29.11 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  27.78 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63450  hypothetical protein  29.11 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2126  plasmid stabilization system protein  32.1 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  0.081563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  29.11 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  34.09 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  39.44 
 
 		 95 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  26 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  36 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  29.89 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0279  plasmid stabilization system  27.37 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0369272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  32.58 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  29.79 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  39.13 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  32.47 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2937  plasmid stabilization system  27.38 
 
 		 106 aa  40  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 99 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>