61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3231 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 94 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  66.67 
 
 		 97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  49.4 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  56.98 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  50 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  52.7 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  50 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  49.4 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  46.58 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  48.57 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  42.22 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  49.32 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  41.57 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.7 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  47.89 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.83 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  40.45 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.33 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  45.45 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.58 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  52.54 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  47.3 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  33.71 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  40.45 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  36.14 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  38.82 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  49.32 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  35.96 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  46.27 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  39.13 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  45.21 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  40.54 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.83 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.83 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.83 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  34.83 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  34.83 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  32.61 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.82 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  41.33 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.83 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  41.79 
 
 		 348 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.3 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  45.07 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  37.36 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  37.36 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  37.18 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  44.12 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  36.26 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  37.88 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  39.44 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.46 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  38.67 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 95 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  36.73 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  44.29 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>