74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4779 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  100 
 
 
79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  50 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  44.16 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.32 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  42.11 
 
 
94 aa  76.6  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  47.95 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  44.3 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  43.04 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  43.24 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.7 
 
 
95 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  47.56 
 
 
99 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  47.3 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  47.3 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  47.37 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  44 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  42.11 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  41.33 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  42.11 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.45 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  45.45 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.45 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.45 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.59 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  48 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.45 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.06 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.54 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  36.84 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.59 
 
 
109 aa  60.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  36.49 
 
 
90 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 
94 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  39.47 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.21 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  43.24 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  38.16 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  40.54 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  40.26 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  54 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  36.49 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  39.47 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  38.96 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  40.3 
 
 
348 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  37.84 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  43.42 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.21 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.89 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  43.42 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  50.67 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  36.49 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  46.3 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  42.11 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  34.21 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  42.11 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  36.49 
 
 
94 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  35.06 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  41.33 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  32.05 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  44.3 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  30.14 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  37.33 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  30.26 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  29.33 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  37.33 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  30.14 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  34.72 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  32.39 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  26.58 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.99 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  27.78 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0579  hypothetical protein  31.34 
 
 
95 aa  40.8  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.714187  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  36.62 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>