89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3590 on replicon NC_009471
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3627  plasmid stabilization system protein  80.68 
 
 		 103 aa  150  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0782046  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  49.45 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  48.35 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.45 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.66 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  41.67 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  42.86 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  38.64 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  32.97 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  35.96 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  38.64 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  43.42 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  40.23 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  40.54 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  38.64 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  37.93 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  42.11 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  38.27 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  36.47 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  35.71 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  43.48 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  40 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  38.04 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  37.93 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  37.08 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  29.67 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  37.31 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  35.56 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  32.94 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  38.71 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  39.47 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  34.44 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.47 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.58 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  33.75 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  40.62 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  36.59 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  38.55 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  34.18 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  38.04 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.94 
 
 		 348 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.33 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.44 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  32.1 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  30.86 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  33.7 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  37.04 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  31.11 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  36.71 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  47.92 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  35.23 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.4 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4208  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.24 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  33.7 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  32.97 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  37.93 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  37.68 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 		 103 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  43.14 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  41.18 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2829  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2757  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2059  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0175569  normal  0.0247897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1314  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  37.35 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  37.35 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  37.23 
 
 		 103 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  32.94 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  28.24 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  41.18 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  28.24 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 100 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>