70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7132 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
95 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  89.58 
 
 
96 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  47.83 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  48.91 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.91 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  46.24 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  40 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  52.7 
 
 
79 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  39.13 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  43.01 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  41.3 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  44.09 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.18 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  43.96 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  40 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  38.46 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  41.49 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  42.11 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.11 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.11 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.11 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  35.11 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  40.86 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  38.46 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  38.71 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.05 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  44.9 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  46.67 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  39.78 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  36.67 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.63 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  34.04 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  39.13 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.56 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  43.33 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  36.17 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.3 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  47.17 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  36.67 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  36.36 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  50.94 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  39.36 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  39.36 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  38.71 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.61 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  33.7 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  35.21 
 
 
348 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2581  plasmid stabilization system  35.79 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1149  plasmid stabilization system  35.79 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  39.33 
 
 
92 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.61 
 
 
96 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  36.56 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.73 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  36.56 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  35.62 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  31.52 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  28.57 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  36.56 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  36.26 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>