77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0444 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  54.95 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  52.75 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  51.65 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  51.69 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  48.35 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  46.07 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.59 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  41.57 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  46.15 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  45.98 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  46.51 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  44 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  45.05 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.38 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  45.57 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  38.82 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.86 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.36 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.86 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.33 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  41.33 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.33 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.33 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  44 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  40.91 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  42.86 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  41.33 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  44 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  34.67 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  42.67 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  38.67 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  37.21 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.9 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  43.02 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  41.33 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  41.86 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  41.86 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  42.67 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  33.72 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  49.02 
 
 		 348 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  40.7 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  38.67 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  39.47 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.67 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  40 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  38.16 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  38.55 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  37.93 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  50.98 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  37.93 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  48.39 
 
 		 90 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  37.33 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  36.47 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.05 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  52.63 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  41.33 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  36.67 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  39.56 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  37.65 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  35.23 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  37.8 
 
 		 97 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  35.14 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  37.33 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4386  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  34.57 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.05 
 
 		 103 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  35.9 
 
 		 95 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  41.51 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  34.57 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.05 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  40.86 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>