19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  97.85 
 
 
93 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  40 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  40.91 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  38.37 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  36.9 
 
 
93 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  33.72 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  32.56 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  29.89 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  29.76 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  31.4 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  28.09 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  30.23 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  34.57 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  29.41 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.07 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  28.09 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  34.88 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>