85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3172 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  100 
 
 		 102 aa  209  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  58.59 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  57.78 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  56.67 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  57.78 
 
 		 100 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  55.1 
 
 		 100 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  55.56 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  53.06 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  45.54 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  51 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  54.43 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  45.88 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  39.18 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  41.05 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  43.33 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  40 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  42.25 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  34.48 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  36.26 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  35.29 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  35.11 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  36.56 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  31.11 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  39.77 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2829  plasmid stabilization system protein  40.48 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.64 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.64 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  38.64 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.64 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  32.58 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  36.26 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  36.78 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  33.73 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  50.98 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.64 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  38.2 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  33.94 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  31.25 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  37.21 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  34.07 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  37.21 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1389  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  26.14 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.65 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  30 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.87 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.71 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1409  plasmid stabilization system protein  29.21 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  34.72 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  30.93 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.89 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  35.23 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.71 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  29.89 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  34.48 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  34.94 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  34.44 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  37.14 
 
 		 73 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  34.09 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  41.18 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0200  hypothetical protein  34.88 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  32.88 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.82 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01510  hypothetical protein  34.88 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34133  normal  0.648522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>