50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0543 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  100 
 
 		 104 aa  213  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  60.4 
 
 		 100 aa  123  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  60.4 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  60.61 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  59.41 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  62.63 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  59.41 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  60 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  56.57 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  55.68 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  51 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.78 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  45.12 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  42.47 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  41.1 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  42.39 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  42.39 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  32.61 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  34.34 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  34.02 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  31.96 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  32 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  38.96 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  34.25 
 
 		 98 aa  50.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  31.96 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  35 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  32.88 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  34.15 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  30.93 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1406  hypothetical protein  40.74 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00275474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  26.32 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.63 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  34.57 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  27.63 
 
 		 96 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  35.87 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  34.78 
 
 		 99 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  27.63 
 
 		 96 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  34.44 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2911  plasmid stabilization system  28.77 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.33 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  33.33 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.71 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  37.14 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 101 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  31.58 
 
 		 101 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>