44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1354 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  100 
 
 		 103 aa  201  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  69.39 
 
 		 99 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  60.42 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  58.7 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  47.73 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  45.56 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  44.44 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.09 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  43.01 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  48.39 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  36.46 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  40 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  43.33 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  35.35 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  42.39 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  36.08 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  43.55 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  30.43 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  34.88 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  28.43 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  26.44 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  30.11 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  34.09 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.5 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  29 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  30.38 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.43 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  27.84 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3026  plasmid stabilization system  32.99 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  31.96 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  32.05 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  38.46 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1406  hypothetical protein  43.4 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00275474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  25 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  28.87 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  24.18 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  24.18 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>