71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02600 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  205  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  97 
 
 
100 aa  200  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  89.8 
 
 
100 aa  185  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  84 
 
 
100 aa  176  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  82 
 
 
100 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  81.82 
 
 
101 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  70.41 
 
 
103 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  77.01 
 
 
87 aa  141  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  61.22 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  60.4 
 
 
104 aa  123  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  57.78 
 
 
102 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.18 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  35.29 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03336  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  41.46 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  41.67 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  38.3 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  34.34 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  40 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  33.71 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  34 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  35.35 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  31 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  31.31 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  36.96 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  35.23 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  31.96 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  35.11 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  31.46 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 
99 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.33 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  30.34 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  28.57 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  28.41 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  32.61 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.18 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  29.41 
 
 
112 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  25.53 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  28.71 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  29.21 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  29.21 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  31.33 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  30.86 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  34 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.14 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  25.96 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1691  plasmid stabilization system  32 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  25.96 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  29.58 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2695  plasmid stabilization system protein  31.03 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2238  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  32.38 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  32.22 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  29.35 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.84 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  28.57 
 
 
101 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  28.57 
 
 
101 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  37.08 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.09 
 
 
97 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 
95 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  27.66 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  31.18 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4492  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.05 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000251401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  29.9 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.43 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  38.2 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1406  hypothetical protein  37.04 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00275474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  30.68 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  40.82 
 
 
94 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>