72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0585 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  35.16 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  37.36 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  36.26 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0861  plasmid stabilization system protein protein  39.29 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.07 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  30.77 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  32.97 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02594  hypothetical protein  35.71 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  36.17 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.16 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1424  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0151743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5346  plasmid stabilization system  31.87 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461356 
 
 
-
 
NC_004310  BR0407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3467  plasmid stabilization system  35.71 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0480  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  27.91 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2977  plasmid stabilization system protein  25.88 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.302564  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  31.11 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  30.23 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  28.26 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3514  plasmid stabilization system protein  32.26 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  28.75 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1354  plasmid stabilization system family protein  26.44 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  31.11 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0815  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000215644  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0909  hypothetical protein  27.47 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000839135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1796  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  28.89 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  30 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  26.14 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.66 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0042  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2332  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  30.86 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  28.89 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.86 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3627  plasmid stabilization system protein  25.56 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0782046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  29.21 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.23 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  28.92 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.21 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0164  plasmid stabilization system  29.85 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000911041  unclonable  6.83121e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  29.63 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2563  plasmid stabilization system protein  25.58 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0878683  normal  0.0161752 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  25 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  29.41 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  27.27 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  29.55 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  25 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  28.05 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  26.25 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  26.74 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3353  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535805  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0300  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.94 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0922  plasmid stabilization system  24.14 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3199  addiction module antitoxin  25.88 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  25.84 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  25.84 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  32.58 
 
 		 97 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>