28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1683 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  100 
 
 		 91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  69.23 
 
 		 91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5346  plasmid stabilization system  69.23 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  59.34 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  59.34 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  59.34 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  59.34 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  59.34 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  59.34 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  62.64 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  53.85 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0480  plasmid stabilization system protein  40.66 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  41.76 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  30.85 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3002  plasmid stabilization system  34.78 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  29.55 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  28.09 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  34.09 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1318  plasmid stabilization system protein  35.14 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000683206  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  25.29 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0925  plasmid stabilization system protein  40.38 
 
 		 96 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.785329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.67 
 
 		 109 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  29.67 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  31.87 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>