30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5046 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  100 
 
 		 91 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  68.13 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  68.13 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  64.84 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5346  plasmid stabilization system  69.23 
 
 		 91 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  59.34 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  53.85 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  60.44 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0480  plasmid stabilization system protein  45.05 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  37.36 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  34.07 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1248  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000697108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  28.12 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  30.23 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  31.18 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  24.14 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  31.03 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0806  plasmid stabilization system  28.92 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.11619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  23.6 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  25 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  25 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>